حذر الكثير من الأشخاص من تطبيقات خبيثة مشابهة للعبة بوكيمون غو الأصلية. وتنكرت هذه التطبيقات بأسماء مشابهة لتطبيق "Pokemon Go" الأصلي، والذي يجذب الناس الباحثين عن الإرشادات والحيل وفقا لتقرير نشره موقع "ESET". وتوجد هذه التطبيقات على متجر "Google Play"، والتي تمثّل خطراً كبيراً على الهواتف الذكية، فمثلاً تطبيق "Pokémon Go Ultimate "، يقوم بغلق شاشة الموبايل بالعمد عند بدء التطبيق، مما يدفهم لإزالة البطارية من أجل إعادة تشغيل الجهاز أو استخدام " Device Manager"، ورغم ذلك فإن البرنامج يظل يعمل في الخلفية، بجانب ظهور إعلانات إباحية غير مرغوبة، مما يدفع البعض لإلغاء تثبيت "PI Network"، بحسب موقع Gizmodo للأخبار التقنية. وهناك تطبيقان آخران من نوعية "Scareware"، والتي تعني خداع المستخدمين لدفع أموال في خدمات غير ضرورية، وهما "Guide & Cheats for Pokémon Go" و"Install Pokemongo"، حيث يتم خداع المستخدمين بإعطائهم خدمات كتطوير Pokéballs أو Lucky Eggs. كلا التطبيقين تمّ مسحهما من على متجر التطبيقات، لكن ليس قبل أن يتم تحميلهما آلاف المرات. ومن أجل الوقاية من هذه المخاطر، فإنه يفضل عدم استخدام تطبيقات الطرف الثالث، ولكن إذا كنت مجبراً لتحميل برامج كبرامج "cheating"، فاقرأ وصف المصمم وتعليقات المستخدمين، وإذا أحسست بأمرٍ غريب، فلا تحمله.