يحرص الكثير من الأشخاص على استخدام مطهر اليدين لقتل الجراثيم والوقاية من الأمراض، لدرجة أنّ البعض يضعونه فى حقائبهم أينما ذهبوا ولا يمكنهم الاستغناء عنه. و مطهر اليدين مفيد في قتل البكتريا والجراثيم لكن الإفراط في استخدامه يسبب أضراراً كثيرة منها:1- يدخل الكحول في تركيب مطهر اليدين بنسبة 60-90% مثل أيزوبوبانول أو إيثانول أوبروبانول، وكلّها مواد تؤثر على البشرة وتعرضها للجفاف ومن ثم تزيد من معدل الإصابة بالتجاعيد، لذا يُنصح باستعمال مرطبات بعد استخدامه.2- هذه المواد لا تتطاير من اليدين بالسرعة المطلوبة وبالتالي تدخل في الدورة الغذائية للفرد وقد تصيبه بالتسمم.3- يعتبر تهيّج العينين أحد الآثار الجانبية للاستعمال غير السليم لمطهر اليدين. 4- الإفراط في استخدامه يسبب ضعف مناعة الجسم.5- العطور التى يحتوي عليها المطهر وكذا مادة ثنائي الفينول الكيميائية قد تؤدي على المدى البعيد إلى حدوث خلل في الهرمونات أو تسبب السرطانات.6- مطهر اليد لا يقتل الجراثيم بالصورة التي تعرضها دعايات تلك المطهرات.7- كما أنّه قد يُحدث التهاب الجلد أو الإكزيما نتيجة الحساسية من الكحول الموجود في مطهر اليدين.